연구자의 일기

🔬 Single nucleus RNA-seq (snRNA-seq)의 개요snRNA-seq은 세포 전체가 아닌, 핵(nucleus)만을 분리하여 RNA를 분석하는 기술로, 특히 조직 보존 상태가 좋지 않거나, 세포 전체를 분리하기 어려운 조직에서 강점을 가진다. 이 기법은 다음과 같은 절차를 따른다:조직에서 핵 분리 (Nuclei isolation)기계적 또는 화학적 방법으로 조직에서 핵만 분리핵 RNA 추출 및 라이브러리 제작mRNA 대신 pre-mRNA(intronic RNA 포함)도 포착시퀀싱 및 분석세포 유형 구분, 클러스터링, pseudotime 분석 등이 가능🧬 snRNA-seq vs. scRNA-seq 비교 분석항목 scRNA-seq (single cell RNA-seq) snRNA-seq..

🔁 먼저, RNA-seq의 핵심 개념 요약RNA-seq은 세포나 조직에서 RNA를 추출한 뒤, 이를 cDNA로 역전사하여 고속 시퀀싱(Next-Generation Sequencing, NGS)을 수행함으로써, 어떤 유전자가 얼마나 발현되고 있는지를 정량적으로 측정하는 기술이다. 이는 생명과학 연구에서 전사체(transcriptome)를 분석하는 데 가장 강력한 도구 중 하나로 자리잡았다. 2025.07.25 - [Biology/Genomics] - RNA sequencing (RNA-seq)의 원리와 역사 RNA sequencing (RNA-seq)의 원리와 역사📘 RNA Sequencing(RNA-seq)의 원리와 역사1️⃣ RNA-seq이란 무엇인가?RNA sequencing, 줄여서 RNA-se..

📘 RNA Sequencing(RNA-seq)의 원리와 역사1️⃣ RNA-seq이란 무엇인가?RNA sequencing, 줄여서 RNA-seq은 세포 내에서 발현되고 있는 모든 RNA, 특히 전령 RNA(mRNA)를 고속으로 읽어들이고 정량화하는 차세대염기서열분석(Next-Generation Sequencing, NGS) 기반의 기술이다. 이 기술을 통해 생물학자는 특정 세포나 조직에서 어떤 유전자가 언제, 얼마나 발현되는지를 정밀하게 파악할 수 있다. 유전자 기능 연구, 질병의 원인 규명, 신약 개발, 진단 바이오마커 탐색 등 다양한 분야에서 핵심 도구로 활용되고 있다.2️⃣ RNA-seq의 등장 배경과 역사🔹 전사체 분석의 시작: 마이크로어레이RNA-seq 이전에는 주로 마이크로어레이(microa..