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Single nucleus RNA-seq vs. Single cell RNA-seq

🔬 Single nucleus RNA-seq (snRNA-seq)의 개요snRNA-seq은 세포 전체가 아닌, 핵(nucleus)만을 분리하여 RNA를 분석하는 기술로, 특히 조직 보존 상태가 좋지 않거나, 세포 전체를 분리하기 어려운 조직에서 강점을 가진다. 이 기법은 다음과 같은 절차를 따른다:조직에서 핵 분리 (Nuclei isolation)기계적 또는 화학적 방법으로 조직에서 핵만 분리핵 RNA 추출 및 라이브러리 제작mRNA 대신 pre-mRNA(intronic RNA 포함)도 포착시퀀싱 및 분석세포 유형 구분, 클러스터링, pseudotime 분석 등이 가능🧬 snRNA-seq vs. scRNA-seq 비교 분석항목 scRNA-seq (single cell RNA-seq) snRNA-seq..

Biology/Genomics 2025.07.28

📘 Bulk RNA-seq의 한계와 Single Cell RNA-seq의 발전

🔁 먼저, RNA-seq의 핵심 개념 요약RNA-seq은 세포나 조직에서 RNA를 추출한 뒤, 이를 cDNA로 역전사하여 고속 시퀀싱(Next-Generation Sequencing, NGS)을 수행함으로써, 어떤 유전자가 얼마나 발현되고 있는지를 정량적으로 측정하는 기술이다. 이는 생명과학 연구에서 전사체(transcriptome)를 분석하는 데 가장 강력한 도구 중 하나로 자리잡았다. 2025.07.25 - [Biology/Genomics] - RNA sequencing (RNA-seq)의 원리와 역사 RNA sequencing (RNA-seq)의 원리와 역사📘 RNA Sequencing(RNA-seq)의 원리와 역사1️⃣ RNA-seq이란 무엇인가?RNA sequencing, 줄여서 RNA-se..

Biology/Genomics 2025.07.28

RNA sequencing (RNA-seq)의 원리와 역사

📘 RNA Sequencing(RNA-seq)의 원리와 역사1️⃣ RNA-seq이란 무엇인가?RNA sequencing, 줄여서 RNA-seq은 세포 내에서 발현되고 있는 모든 RNA, 특히 전령 RNA(mRNA)를 고속으로 읽어들이고 정량화하는 차세대염기서열분석(Next-Generation Sequencing, NGS) 기반의 기술이다. 이 기술을 통해 생물학자는 특정 세포나 조직에서 어떤 유전자가 언제, 얼마나 발현되는지를 정밀하게 파악할 수 있다. 유전자 기능 연구, 질병의 원인 규명, 신약 개발, 진단 바이오마커 탐색 등 다양한 분야에서 핵심 도구로 활용되고 있다.2️⃣ RNA-seq의 등장 배경과 역사🔹 전사체 분석의 시작: 마이크로어레이RNA-seq 이전에는 주로 마이크로어레이(microa..

Biology/Genomics 2025.07.25

서울대학교 일반전형 _ 11년 전의 후기 _ 하편

** 11년 전의 기억에 의존한 글이다보니 오류가 있을 수 있음 ** 서울대학교 일반전형, 11년 전의 면접 후기입니다. 상편은 아래 링크에 있습니다. ↓ ↓ https://studyingvet.tistory.com/3 서울대학교 일반전형 _ 11년 전의 후기 _ 상편 (feat. 건국대학교)** 11년 전의 기억에 의존한 글이니 오류가 있을 수 있음. ** 이전 포스팅에 카이스트 학교장추천전형 후기를 올린 바 있다. 링크 ↓ https://studyingvet.tistory.com/2 카이스트 학교장 추천 전형 _ 11년 전studyingvet.tistory.com 다음 날 면접보고 바로 다시 서울로 올라가 서울대학교 구술고사 준비를 했다. 구술고사는 또 일주일 뒤에 있었다. [11월 둘째주 수능 ->..

서울대학교 일반전형 _ 11년 전의 후기 _ 상편 (feat. 건국대학교)

** 11년 전의 기억에 의존한 글이니 오류가 있을 수 있음. ** 이전 포스팅에 카이스트 학교장추천전형 후기를 올린 바 있다. 링크 ↓ https://studyingvet.tistory.com/2 카이스트 학교장 추천 전형 _ 11년 전의 후기 나는 카이스트에 가고 싶었다. 과학고 진학을 도전했으나 실패했다. 일반고에 진학해서도 여전히 나는 카이스트에 가고 싶었고, 생물을 좋아했기에 바이오 뇌공학과에 진학하고 싶었다. 일반계 studyingvet.tistory.com 위 글을 쓰면서 당시 입시 현장을 되새겨 보니 더 쓰고 싶은 것들이 있어 몇 자 적어본다. ... 카이스트에는 합격하지 못했지만 그래도 나를 받아준 곳이 있었다. 서울대학교. 고등학교 3학년 입시 시즌까지 나는 오로지 카이스트만 바라보고 ..

카이스트 학교장 추천 전형 _ 11년 전의 후기

나는 카이스트에 가고 싶었다. 과학고 진학을 도전했으나 실패했다. 일반고에 진학해서도 여전히 나는 카이스트에 가고 싶었고, 생물을 좋아했기에 바이오 뇌공학과에 진학하고 싶었다. 일반계 고등학생이 두드려서 열릴 가능성이 높은 문은 '학교장 추천 전형' 이었다. 당시 내가 그 전형에 대해 이것저것 알아보면서 작성했던 블로그 글이 있다. 아래는 그 원본 글의 링크이다. https://blog.naver.com/bark0728/138696063 카이스트-학교장추천전형 이 글은 내가 직접 카이스트 홈페이지를 돌아다니며 수집한 정보를 쓴 것이다. 물론 ... blog.naver.com 고등학교 3학년 여름방학에는 카이누리 (카이스트 홍보동아리)에서 주최하는 카이스트 캠프에 지원했으나 참여하지 못했고 (학교 측 사정..